Cerca de 20 anos após os eventos ED55 Deus Ex, O mundo está apenas começando a recuperar-se de uma depressão catastrófica em todo o mundo. O caótico período de recuperação, várias facções religiosas e políticas ver uma oportunidade de reformularem um governo em todo o mundo a suas agendas, entendendo que o direito se move agora poderia determinar a forma de sociedade humana ao longo de décadas, mesmo séculos. Esta techno-pesadelo, tome parte na luta escura para elevar o mundo a partir de suas próprias cinzas.